整合空間和單核轉錄組數據闡明了具有抑郁樣行為的雌性食蟹猴的小膠質(zhì)細胞特異性反應
發(fā)表時(shí)間:2023 年 7 月
發(fā)表期刊:Nature Neuroscience
影響因子:25
發(fā)表單位:重慶醫科大學(xué)附屬第一醫院
研究背景:根據世界衛生組織(WHO)的數據,自2017年以來(lái),重度抑郁癥(MDD)已成為世界上最主要的殘疾原因之一,其潛在的細胞和分子機制已有研究者對于男性的MDD基于單細胞分辨率進(jìn)行初步探索(Corina Nagy, Nat Neurosci, 2020)。
研究方法:單細胞核測序、空間轉錄組(Visium ST)測序
研究結果:
基于單細胞測序、空間轉錄組測序等多種技術(shù)手段,揭示了細胞類(lèi)型和皮層特
異性基因表達的變化特征。共鑒定出 8個(gè)細胞大類(lèi),240 個(gè)不重復的差異表達基因,這些基因主要富集在膠質(zhì)細胞;研究者同時(shí)采用共表達網(wǎng)絡(luò )分析鎖定了小膠質(zhì)細胞是低等級抑郁猴中改變的關(guān)鍵細胞群;亞型分析發(fā)現了抑郁猴富集的小膠質(zhì)亞型,將其命名為“抑郁相關(guān)小膠質(zhì)細胞(PIMID);進(jìn)一步采用 WGCNA 分析空間組學(xué)數據,揭示了抑郁行為、積極以及消極情緒行為模塊對于基因在空間分布上的差異,而 PIMID主要定位于猴腦解剖腦的第 6 層,以上成果為抑郁癥的靶向干預提供潛在新靶點(diǎn)。