單細胞免疫組庫測序一次實(shí)驗可以同時(shí)檢測近萬(wàn)個(gè)細胞,可在一個(gè)樣本中同時(shí)獲5'端mRNA表達譜、TCR和BCR的信息,結合基因的表達譜和V(D)J數據進(jìn)行復雜組織樣本的影響免疫應答分析,監測免疫療法的效果,研究疾病發(fā)生和發(fā)展的分子機制。
(圖片來(lái)源:Wang Y, et al., Journal of Infection, 2023)
1. 1000+ TCR/BCR項目經(jīng)驗,一次實(shí)驗可同時(shí)獲取1000-10000個(gè)細胞的文庫構建,獲得轉錄組和免疫組數據。
2. 具備完善的免疫組庫測序和實(shí)驗質(zhì)控流程,獲取V(D)J全長(cháng)序列的配對信息。
3. 豐富的免疫組庫測序和數據分析經(jīng)驗,實(shí)現專(zhuān)屬個(gè)性化數據分析服務(wù),搭配單細胞分析云平臺,一鍵導出交互性的動(dòng)態(tài)結果報告。
4、免疫組庫測序經(jīng)驗豐富,助力發(fā)表高分SCI文獻:
樣本類(lèi)型:
組織、血液、培養的細胞系、制備好的單細胞懸液
注:若客戶(hù)樣本為組織,且無(wú)能力進(jìn)行組織解離來(lái)獲取單細胞懸液,烈冰將盡可能提供技術(shù)及實(shí)驗上的幫助,但因不同類(lèi)型樣本的特異性,無(wú)法保證實(shí)驗方法適用于所有類(lèi)型組織。
質(zhì)量要求:
1. 細胞活性大于70%;
2. 濃度為500-2000細胞/μl;
3. 體積不小于200μl;
4. 細胞培養基及緩沖液不能含Ca2+和Mg2+;
5. 細胞體積小于40μm。
V(D)J基因的使用頻率:上圖主要展示了TCR序列中V基因的使用情況
注:橫坐標為V基因,縱坐標為J基因
V-J基因組合頻率:下圖主要展示了TCR序列中V-J基因組合情況。
注:橫坐標為CDR3長(cháng)度分布,縱坐標為細胞占比
CDR3序列長(cháng)度:上圖主要展示了CDR3序列的長(cháng)度分布,以及使用頻率最高的12個(gè)TRAV基因對應的CDR3長(cháng)度信息。
注:橫坐標為clonotype編號,縱坐標為細胞占比
克隆頻率統計:該圖主要展示了TOP50 clonotype對應的細胞占比。
注:Unique或數字: 每個(gè)clonotype對應的細胞數(size)
克隆增殖統計:下圖主要展示了不同size對應的clonotype的占比情況
注:右圖中,XY軸均為cluster編號,括號內為該cluster中檢測到TCR序列的細胞數
注:橫向縱向均為樣本名稱(chēng),括號內為該樣本中檢測到的clonotype數,色塊內為overlap的clonotype數。
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[2] Prmt5 deficiency inhibits CD4+ T-cell Klf2/S1pr1 expression and ameliorates EAE disease. Journal of Neuroinflammation. 2023Aug; IF=9.3
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[4] Tumor-intrinsic YTHDF1 drives immune evasion and resistance to immune checkpoint inhibitors via promoting MHC-I degradation. Nature Communications. 2023 Jan; IF=16.6
[5] Single-Cell Landscape Highlights Heterogenous Microenvironment, Novel Immune Reaction Patterns, Potential Biomarkers and Unique Therapeutic Strategies of Cervical Squamous Carcinoma, Human Papillomavirus_x005f Associated (HPVA) and Non-HPVA Adenocarcinoma. Adv Sci. 2023 Jan; IF=15.1
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